紫檀木念珠的材料一般有小叶紫檀和大叶紫檀两种，其中使用小叶紫檀制作饰品最为广泛，而紫檀木念珠是人们最喜欢的佛教用具之一。为什么选择紫檀木制作佛具呢？带紫檀木念珠对人体有什么特殊的功效吗？

中古世纪医学界在消毒空气方面曾采用紫檀木薰香法来净化空气以利医疗。其主要原因乃檀木燃烧会散发清幽芬芳香气外，本质元素内含杀菌效益，更有稳神定气之神效。黑檀色泽乌黑，质地紧密，香味淡雅悠长。用以装饰尽显庄严，佛教更认为檀木有驱邪避邪之效用。紫檀檀木所散发的香气有益人体心脏、肝脏、肾脏等机能，能有效稳定人体脑波使情绪平衡、安祥、沉静；助益睡眠，更有帮助禅定之效益。

在佛事生成的殿堂里，烟馨缭绕的檀香在佛经中和定心、安神、醒脑、镇邪、通窍连接在一起。紫檀念珠代表了百毒不侵、万古不朽、邪不沾身的对入定诵经者的一种全方位的卫护。明朝李时珍《本草纲目》本部第三十四卷记载：“紫檀――咸、微寒，无毒，能和营气消肿毒”。它含紫檀素，紫檀素溶于酒精或醚，具收敛消肿毒效能，削片、锯屑或磨汁供药用，常用作治疗毒疮。可以抗白蚁及其它害虫。